Here is a list of all documented functions with links to the class documentation for each member:

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• _() : Batch, Local, Calibration, State
• __add__() : Statistic, Bits, ConstBitStream
• __and__() : IntervalOfValidity, IoVSet, Bits
• __bool__() : IoVSet
• __call__() : Transform, GlobalDeformation, BearerAuth, FullHelpAction, DefaultModel, Layer, MultilayerPerceptron, BackgroundTagColorMap, CDCHitColorMap, CDCHitStrokeWidthMap, CDCSegmentColorMap, MCParticleColorMap, MCPDGCodeColorMap, MCPrimaryColorMap, MCSegmentIdColorMap, PosFlagColorMap, ReassignedSecondaryMap, RLColorMap, SegmentFBInfoColorMap, SegmentFirstInTrackIdColorMap, SegmentFirstNPassedSuperLayersColorMap, SegmentLastInTrackIdColorMap, SegmentLastNPassedSuperLayersColorMap, SegmentMCTrackIdColorMap, TakenFlagColorMap, TOFColorMap, WrongRLColorMap, ZeroDriftLengthColorMap, ZeroDriftLengthStrokeWidthMap, Refiner
• __contains__() : IoVSet, Bits, NonstrictChoices
• __copy__() : BitArray, Bits, BitStream, ConstBitStream
• __del__() : RawRootFile
• __delitem__() : BitArray, ValidationFiguresOfMerit
• __enter__() : VCDWriter, Pager, Quiet
• __eq__() : IntervalOfValidity, PayloadInformation, TestingPayloadEntry, Particle, CalculationQueueItem, Bits, State
• __exit__() : VCDWriter, Pager, Quiet
• __get__() : Refiner
• __getattr__() : LogReplacementFilter, AttrDict, SubJob, BASF2StateRecorder, Machine, NoReplacementField
• __getitem__() : ArrayDataset, ModuleStatistics, PriorDataLoader, Bits, ValidationFiguresOfMerit, NoReplacementField
• __getstate__() : MillepedeCalibration
• __hash__() : IntervalOfValidity, PayloadInformation, TestingPayloadEntry, Particle, Bits, HashableCut, State
• __iadd__() : LatexFile, BitArray
• __ilshift__() : BitArray
• __imul__() : BitArray
• __init__() : MinModule, CDCLayerConstraints, CDCTimeZerosConstraint, CDCWireConstraints, Constraint, Constraints, VXDHierarchyConstraints, ConstraintsGenerator, ProTool, ProfilePlot, CDF, ToFlat, Transform, MillepedeCalibration, Bowing, Clamshell, CreateMisalignmentModule, Curl, Elliptical, GlobalDeformation, RadialExpansion, Skew, Telescope, Twist, ZExpansion, AlignmentGeneratorConfig, batch_generator, VariablesToHDF5, VariablesToTable, B2Lexer, ErrorWithExtraVariables, DataStorePrinter, PrintObjectsModule, LogReplacementFilter, DefineColourList, Graphics, Itemize, LatexObject, Listing, LongTable, Section, String, SubSection, SubSubSection, TitlePage, RawRootFile, RawRootFile.Key, AttrDict, ArgumentsGenerator, ArgumentsSplitter, Backend, Batch, HTCondor.HTCondorResult, Job, Local, Local.LocalResult, LSF, LSF.LSFResult, MaxFilesSplitter, MaxSubjobsSplitter, PBS, PBS.PBSResult, Result, SubJob, SubjobSplitter, ConstructorNotFoundError, State, myModel, State, Method, CalculationProcess, CDCCalibration, CDCDedxCalibration, LSFTask, CDCHistMakerModule, CheckNegativeWeights, VxdCdcMergerHarvesterMCSide, VxdCdcMergerHarvesterPRSide, Cluster, ClusterBase, Cluster, ClusterFilterValidationModule, LSFTask, BearerAuth, CommandIoVsHelper, ItemFilter, ConditionsDB, IntervalOfValidity, IoVSet, LocalMetadataProvider, PayloadInformation, RunningTagUpdater, RunningTagUpdaterError, TestingPayloadEntry, GraFEIIgniteTrainer, ArrayDataset, DecayHashMap, DefaultModel, Layer, MultilayerPerceptron, Trainer, TfDataBasf2, TfDataBasf2Stub, Prior, DQM, DumpDigits, Plotter, Priors, EventCountLimiter, EventDisplayer, EventInspector, EventInspectorLookback, EventInspectorPocketDAQ, Particle, FSPLoader, PostReconstruction, PreReconstruction, Teacher, TrainingData, TrainingDataInformation, MonitoringBranchingFractions, MonitoringHist, MonitoringModuleStatistics, MonitoringNTuple, MonitoringParticle, Statistic, InjectPXDDigits, FitValidationModule, Algorithm, CAF, Calibration, CalibrationBase, Collection, VxdCdcPartFinderHarvester, GATGAPModel, GATModule, PrintPXDHits, GraphDataSet, EdgeLayer, GlobalLayer, NodeLayer, GraFEIModel, GraFEIModule, FitHarvester, MCParticleHarvester, MCTrajectoryHarvester, PXDHarvester, ReconstructionPositionHarvester, SeedsAnalyser, SegmentFakeRatesModule, SegmentFinderParameterExtractorModule, SVDHarvester, VXDHarvester, WrongRLInfoCounter, Calculation, CalculationProcess, CalculationQueue, CalculationQueueItem, Statistics, StatisticsColumn, StoreContent, StoreContentList, EnvironmentInformation, IPythonHandler, Basf2Calculation, Basf2CalculationProcess, Basf2CalculationQueueStatistics, ModuleStatistics, Basf2EnvironmentInformation, Basf2ModulesInformation, Basf2IPythonHandler, PrintCollections, ProgressPython, DependencyViewer, ModuleViewer, PathViewer, CollectionsViewer, LogViewer, ProcessViewer, ProgressBarViewer, StatisticsViewer, Histograms, CleanBasf2Execution, MyFancyClassifier, Comparison, ComparisonHtmlContent, ComparisonNTuple, ComparisonPackage, ComparisonPlot, ComparisonPlotFile, ComparisonResult, ComparisonRevision, HtmlContent, NTuple, Package, Plot, PlotFile, Revision, Revisions, Script, EnhancedRelations, Relations, KLMAlignment, KLMChannelStatus, KLMStripEfficiency, KLMK0LPlotModule, Node, LCASaverModule, EventRangePathSplitter, ExtraInfoPathSplitter, Mails, MetaOptionParser, PerfectEvent, PerfectLCA, PerfectMasses, MultiTrainLoss, NNFilterModule, data_production, SaveFlag, TrainDataSaver, Statistics, StatisticsVisitor, PerEventStatisticsGetterModule, PhokharaEvtgenAnalysisModule, TreeWriterModule, WeightNet, MinModule, PlotClusterPositionEstimatorPayload, Box, Correlation, CorrelationMatrix, Difference, Distribution, Multiplot, Overtraining, Plotter, VerboseDistribution, fast_equal_frequency_binning, CheckTrueHits, PriorDataLoader, PriorModel, Model, Attention, bn, CBAM_attention, ccbn, EncoderBlock, GBlock, Generator, ILA, Model, MultiheadAttention, myBN, RelationalReasoning, SN, SNConv2d, SNEmbedding, SNLinear, Model, ResidualBlock, PXDBackgroundGenerator, CalibrationCheckerBase, PXDHotPixelMaskCalibrationChecker, ConditionCheckerBase, PXDDeadPixelsChecker, PXDGainMapChecker, PXDMaskedPixelsChecker, PXDOccupancyInfoChecker, PXDHitErrors, PXDHitErrorsTTree, QAM, RootQuantityExtract, ElossHarvestingModule, LegendreBinningValidationModule, SegmentFitValidationModule, ParticleStatisticsModule, early_stopping, TrackingValidationResult, RunDB, AlgorithmsRunner, SeqAlgorithmsRunner, CheckMCParticles, Saving1stMVAData, Saving2ndMVAData, BitArray, Bits, BitStream, ConstBitStream, ConstByteStore, EffModule, Variable, VCDWriter, SegmentPairCreationValidationModule, SetVXDSensitiveThreshold, Model, myModel, DownloadableDatabase, SummarizeTriggerResults, SummarizeTriggerVariables, SplitMultiplicities, AlgorithmMachine, CalibrationMachine, Machine, State, RandomTestModule, AlgorithmStrategy, SequentialBoundaries, SequentialRunByRun, SimpleRunByRun, SingleIOV, dump_clusters, dump_digits, SVDExtraEventStatisticsModule, skim6SampleEventsPyModule, skimFineTRGEventsPyModule, skimLowHighEventT0EventsPyModule, skimOutRNDTrgModule, skimSVDBurstEventsModule, skimSVDTriggerBinEventsPyModule, SampleGenerator, tau_encoder, SVDChargeSharing, testSVDShaperDigitOrdering, SVDValidationTTreeCluster, SVDValidationTTreeRecoDigit, SVDValidationTTreeRecoTrack, SVDValidationTTreeSimhit, SVDValidationTTreeSpacePoint, SVDValidationTTreeStrip, SVDValidationTTreeTrueHit, Reweighter, InputEditor, Pager, Quiet, TCCE, MCParticleColorMap, MCPrimaryColorMap, TakenFlagColorMap, WrongRLColorMap, CDCSVGPlotter, HitCleaner, HarvestingModule, CdRefiner, ExpertLevelRefiner, FilterRefiner, GroupByRefiner, Plot2DRefiner, Refiner, SaveClassificationAnalysisRefiner, SaveFiguresOfMeritRefiner, SaveHistogramsRefiner, SavePullAnalysisRefiner, SaveTreeRefiner, SelectRefiner, CombinedTrackingValidationModule, EventwiseTrackingValidationModule, MCSideTrackingValidationModule, PRSideTrackingValidationModule, EventInfoHarvester, HitInfoHarvester, TrackInfoHarvester, IfMCParticlesPresentModule, IfModule, IfStoreArrayPresentModule, PathModule, PyProfilingModule, WrapperModule, EmptyRun, Reader, ClassificationAnalysis, CutAtBackgroundRejectionClassifier, CutClassifier, ValidationFiguresOfMerit, ExpertTrackingValidationModule, FilterProperties, TrackingValidationModule, PullAnalysis, ResolutionAnalysis, NoReplacementField, ClassificationOverview, DEDXEstimationTrainer, FittedGroupedDEDXEstimatorTrainer, FunctionFittedGroupedDEDXEstimatorTrainer, GaussianEstimatorTrainer, GaussianEstimatorTrainerSQRT, LandauEstimatorTrainer, LandauEstimatorTrainerSQRT, MaximumEstimatorTrainer, MaximumEstimatorTrainerSQRT, MedianEstimatorTrainer, MedianEstimatorTrainerSQRT, MVADEDXEstimationTrainer, V0ValidationPlots, CosmicAnalysis, IntervalSelector, ValidationMetadataSetter, AndersonDarlingTest, Chi2Test, ComparisonBase, KolmogorovTest, PvalueTest, TablePrinter, ValidationRoot, DecayParticleNode, VxdCdcMergerValidationPlots, VxdCdcMergerHarvester, QueueDrawer, QueueHarvester, Model, TrivialModel, SleepOnInitModule
• __invert__() : Bits
• __irshift__() : BitArray
• __iter__() : RawRootFile, PyStoreArray, StoreWrapper< T >, IoVSet, ArrayDataset, Calculation, NonstrictChoices, ValidationFiguresOfMerit
• __le__() : TestingPayloadEntry
• __len__() : PyDBArray, PyStoreArray, IoVSet, ArrayDataset, Calculation, PriorDataLoader, Bits, ValidationFiguresOfMerit
• __lshift__() : Bits
• __lt__() : IntervalOfValidity, PayloadInformation, TestingPayloadEntry
• __mul__() : Bits
• __ne__() : Bits
• __next__() : RawRootFile
• __nonzero__() : Bits
• __or__() : IntervalOfValidity, IoVSet, Bits
• __radd__() : Statistic, Bits
• __rand__() : Bits
• __repr__() : Job, SubJob, SubjobSplitter, State, Const::ParticleType, EvtGenParticlePDG, IntervalOfValidity, IoVSet, TestingPayloadEntry, Calibration, EnvironmentInformation, Basf2CalculationQueueStatistics, Bits, State
• __rmul__() : Bits
• __ror__() : Bits
• __rshift__() : Bits
• __rxor__() : Bits
• __setitem__() : BitArray, ValidationFiguresOfMerit
• __setstate__() : MillepedeCalibration
• __str__() : LatexObject, Const::DetectorSet, HitPatternCDC, HitPatternVXD, SVDModeByte, Vector2D, Vector3D, VxdID, ItemFilter, Particle, Statistic, EnvironmentInformation, Basf2CalculationQueueStatistics, Bits, State, ReweighterParticle, BackgroundTagColorMap, MCPDGCodeColorMap, MCPrimaryColorMap, PosFlagColorMap, RLColorMap, WrongRLColorMap, NonstrictChoices, ValidationFiguresOfMerit, ValidationManyFiguresOfMerit
• __sub__() : IntervalOfValidity, IoVSet
• __walk() : DecayParticleNode
• __xor__() : Bits
• _add_batch_directives() : Batch, HTCondor, LSF, PBS
• _add_callbacks() : State
• _add_setup() : Backend
• _add_wrapper_script_setup() : Backend
• _add_wrapper_script_teardown() : Backend
• _append() : Bits
• _appendstore() : ConstByteStore
• _apply_calibration_defaults() : CalibrationBase
• _assertsanity() : Bits
• _below_max_iterations() : CalibrationMachine
• _build_iov_dicts() : CalibrationMachine
• _callback() : Machine
• _change_working_dir() : AlgorithmMachine
• _check_all() : RunningTagUpdater
• _check_backend() : CAF
• _check_if_same() : Mails
• _check_running_tag() : RunningTagUpdater
• _check_staging_tag() : RunningTagUpdater
• _check_staging_tag_simple() : RunningTagUpdater
• _check_state() : RunningTagUpdater
• _check_timescale() : VCDWriter
• _check_valid_collector_output() : CalibrationMachine
• _clean_config_dict() : GraFEIIgniteTrainer
• _cleanup() : Cluster
• _clear() : Bits, ConstBitStream
• _closing_ops() : Trainer
• _collect_weights_and_biases() : MultilayerPerceptron
• _collection_completed() : CalibrationMachine
• _collection_failed() : CalibrationMachine
• _collector_jobs_ready() : CalibrationMachine
• _compose_message() : Mails
• _compute() : AndersonDarlingTest, Chi2Test, ComparisonBase, KolmogorovTest, PvalueTest
• _convert_teff_to_hist() : ComparisonBase
• _converttobitstring() : Bits
• _copy() : Bits
• _create_cmd() : Batch, HTCondor, LSF, PBS
• _create_collector_jobs() : CalibrationMachine
• _create_job_result() : Batch, HTCondor, LSF, PBS
• _create_mail_log() : Mails
• _create_mail_log_failed_scripts() : Mails
• _create_output_dir() : AlgorithmMachine
• _create_parent_job_result() : Backend, HTCondor, Local, LSF, PBS
• _default_environment_editor() : InputEditor
• _default_termination_criterion() : DefaultModel
• _delete() : Bits
• _dump_job_config() : CalibrationMachine
• _dump_off() : VCDWriter
• _dump_values() : VCDWriter
• _ensure_zero_error_has_no_content() : Chi2Test
• _ensureinmemory() : Bits
• _execute_over_iov() : AlgorithmMachine
• _finalize_registration() : VCDWriter
• _findbytes() : Bits
• _findregex() : Bits
• _fit() : CDF, ToFlat, Transform
• _flag_new_failures() : Mails
• _force_full_report() : Mails
• _format_value() : VectorVariable
• _gen_header() : VCDWriter
• _get() : PyDBArray
• _get_comparison_result() : ComparisonBase, PvalueTest
• _get_comparison_result_long() : AndersonDarlingTest, Chi2Test, ComparisonBase, KolmogorovTest, PvalueTest
• _get_default_collection_attribute() : Calibration
• _get_learning_rate() : DefaultModel
• _get_momentum() : DefaultModel
• _get_overall_status_from_subjobs() : Job
• _get_scope_tuple() : VCDWriter
• _get_status_from_output() : LSF.LSFResult, PBS.PBSResult
• _get_tmp_name() : Cluster
• _getbin() : Bits
• _getbitpos() : ConstBitStream
• _getbytepos() : ConstBitStream
• _getbytes() : Bits
• _getfloat() : Bits
• _getfloatle() : Bits
• _gethex() : Bits
• _getint() : Bits
• _getintbe() : Bits
• _getlength() : Bits
• _getoct() : Bits
• _getse() : Bits
• _getsie() : Bits
• _getue() : Bits
• _getuie() : Bits
• _getuint() : Bits
• _getuintbe() : Bits
• _has_compatible_bins() : ComparisonBase
• _has_correct_types() : ComparisonBase
• _ilshift() : Bits
• _imul() : Bits
• _increment_iteration() : CalibrationMachine
• _init_bias() : Layer
• _init_weight() : Layer
• _initialise() : Transform
• _inplace_logical_helper() : Bits
• _insert() : Bits
• _instance() : PythonVariableManager
• _invert() : Bits
• _invert_all() : Bits
• _iov_requested() : CalibrationMachine
• _irshift() : Bits
• _is_running() : HLTZMQTestCase
• _log_new_state() : CalibrationMachine
• _make_collector_path() : CalibrationMachine
• _make_database() : CAF
• _make_output_dir() : CAF, CalibrationMachine
• _make_pre_collector_path() : CalibrationMachine
• _make_submit_file() : Batch, HTCondor
• _no_require_iteration() : CalibrationMachine
• _obj() : PyDBObj
• _order_calibrations() : CAF
• _overwrite() : Bits
• _pagination() : RunDB
• _perfect_score_fn() : GraFEIIgniteTrainer
• _plot_datapoints() : Plotter
• _poll_collector() : Calibration
• _pre_algorithm() : AlgorithmMachine
• _prepare_final_db() : CalibrationMachine
• _prepare_monitoring() : Trainer
• _prepare_tensorboard() : Trainer
• _prepend() : Bits
• _prependstore() : ConstByteStore
• _printObj() : DataStorePrinter
• _printResult() : DataStorePrinter
• _prompt_for_editor() : InputEditor
• _prune_invalid_collections() : CAF
• _raise_has_compatible_bins() : ComparisonBase
• _raise_has_correct_types() : ComparisonBase
• _readbin() : Bits
• _readbits() : Bits
• _readbytes() : Bits
• _readfloat() : Bits
• _readfloatle() : Bits
• _readhex() : Bits
• _readint() : Bits
• _readintbe() : Bits
• _readintle() : Bits
• _readoct() : Bits
• _readse() : Bits
• _readsie() : Bits
• _readtoken() : Bits
• _readue() : Bits
• _readuie() : Bits
• _readuint() : Bits
• _readuintbe() : Bits
• _readuintle() : Bits
• _recover_collector_jobs() : CalibrationMachine
• _remove_comment_lines() : InputEditor
• _remove_missing_dependencies() : CAF
• _require_iteration() : CalibrationMachine
• _reset_LCA() : LCASaverModule
• _reset_parameters() : MultiheadAttention
• _resolve_file_paths() : CalibrationMachine
• _resolve_id() : LocalMetadataProvider
• _reverse() : Bits
• _reversebytes() : Bits
• _rphiz_to_xyz() : GlobalDeformation
• _run_algorithms() : CalibrationMachine
• _run_strategy() : SeqAlgorithmsRunner
• _runner_failed() : CalibrationMachine
• _runner_not_failed() : CalibrationMachine
• _save_best_state() : Trainer
• _score_fn() : GraFEIIgniteTrainer
• _set() : Bits
• _set_default_collection_attribute() : Calibration
• _set_input_data() : AlgorithmMachine
• _set_optimizer() : DefaultModel
• _setauto() : Bits
• _setbin_safe() : Bits
• _setbin_unsafe() : Bits
• _setbitpos() : ConstBitStream
• _setbytepos() : ConstBitStream
• _setbytes_safe() : Bits
• _setbytes_unsafe() : Bits
• _setfile() : Bits
• _sethex() : Bits
• _setint() : Bits
• _setintbe() : Bits
• _setoct() : Bits
• _setse() : Bits
• _setsie() : Bits
• _setue() : Bits
• _setuie() : Bits
• _setuint() : Bits
• _setuintbe() : Bits
• _setup_database_chain() : AlgorithmMachine
• _setup_logging() : AlgorithmMachine
• _slice() : Bits
• _submit_collections() : CalibrationMachine
• _submit_to_batch() : Batch, HTCondor, LSF, PBS
• _test_examples_dir() : ExamplesTest
• _train_epoch() : Trainer
• _transform() : CDF, ToFlat, Transform, Bowing, Clamshell, Curl, Elliptical, GlobalDeformation, RadialExpansion, Skew, Telescope, Twist, ZExpansion
• _trigger() : Machine
• _truncateend() : Bits
• _truncatestart() : Bits
• _unset() : Bits
• _update_cal_state() : CalibrationMachine
• _update_result_status() : HTCondor.HTCondorResult, Local.LocalResult, LSF.LSFResult, PBS.PBSResult
• _validate_slice() : Bits
• _xyz_to_rphiz() : GlobalDeformation